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Installation d'openjre 8 et de geonetwork 3.2.1
Prise de notre rapide pour debian jessie en mai 2017. Sur une machine toute neuve sans rien d'autre installé que les utilitaires de base.
toutes les commandes sont à passer sous le compte root. root est réputé avoir bash comme shell.
toutes les commandes montrées sont faites pour être copiées/collées d'un seul coup.
Installation openjdk-8-jre-headless
Installation préalable de optnjdk-7. pour des histoires de dépendance de paquet. Puis il faut installer manuellement ca-certificates-java_20161107_all.deb, sinon, on ne pourra pas installer openjdk-8, à cause de conflits entre ca-certificates-java et openjdk-8. Solution, aller chercher manuellement le paquet sur packages.debian.org dans unstable. installer le paquet.
apt install openjdk-7-jre-headless wget http://ftp.fr.debian.org/debian/pool/main/c/ca-certificates-java/ca-certificates-java_20161107_all.deb dpkg -i ca-certificates-java_20161107_all.deb
Installer openjdk-8-jre-headless. cf http://stackoverflow.com/questions/35130798/install-java-8-in-debian-jessie
echo deb http://http.debian.net/debian jessie-backports main >> /etc/apt/sources.list apt update && apt install openjdk-8-jre-headless apt purge openjdk-7-jre-headless # plus besoin maintenant. update-alternatives --config java
installation tomcat8
apt-get -y install \ tomcat8 libpostgresql-jdbc-java \ libpostgis-java postgresql-client
et puis donner de la mémoire à tomcat, plein de mémoire à la JVM pour geonetwork. Au strict minimum 2Go. ici, on donne 2048 de RAM, soit 2 Go à la JVM. Mais en prod, j'ai du mettre plus, sinon, boom la JVM manque de mémoire et s'arrête.
sleep 2 systemctl stop tomcat8 sed -i -e 's/^\(JAVA_OPTS=.*\)-Xmx[^ ]*\(.*\)/\1-Xms2048m -Xmx2048m -XX:+UseConcMarkSweepGC\2/' /etc/default/tomcat8 # Ne pas redémarrer tomcat8 maintenant.
installation de geonetwork 3.2.1
- tomcat8 est toujours arrêté
- donner le dossier
/var/lib/tomcat8à tomcat8 car geonetwork va tenter de créer une base de données H2 juste dans ce dossier. Par défaut ce dossier appartient à root et seuls certains sous dossiers appartiennent à tomcat8.find /var/lib/tomcat8 -ls >/var/lib/tomcat8/files-and-users chown -hR tomcat8: /var/lib/tomcat8
- Aller chercher le war chez geonetwork.le poser pour l'instant dans
/var/lib/tomcat8/webapps/geonetwork.war. Il peut appartenir à root si on veut ça n'a pas d'importance.cp /tmp/geonetwork.war /var/lib/tomcat8/webapps/geonetwork.war
- démarrer tomcat8, patienter
systemctl start tomcat8
- attendre longtemps avant de tenter de se connecter à cette nouvelle instance.
lancer top et attendre que java passe de 100% de CPU à pas grand chose.- top example
top - 19:02:18 up 41 min, 2 users, load average: 0.73, 0.67, 0.31 Tasks: 77 total, 1 running, 76 sleeping, 0 stopped, 0 zombie %Cpu(s): 94.6 us, 5.4 sy, 0.0 ni, 0.0 id, 0.0 wa, 0.0 hi, 0.0 si, 0.0 st KiB Mem: 8195964 total, 1714800 used, 6481164 free, 992 buffers KiB Swap: 385020 total, 0 used, 385020 free. 1260812 cached Mem PID USER PR NI VIRT RES SHR S %CPU %MEM TIME+ COMMAND 13782 tomcat8 20 0 5186796 312088 17312 S 99.9 3.8 0:13.92 java 1 root 20 0 28696 4748 3072 S 0.0 0.1 0:01.12 systemd 2 root 20 0 0 0 0 S 0.0 0.0 0:00.00 kthreadd 3 root 20 0 0 0 0 S 0.0 0.0 0:00.30 ksoftirqd/0 5 root 0 -20 0 0 0 S 0.0 0.0 0:00.00 kworker/0:0H 6 root 20 0 0 0 0 S 0.0 0.0 0:00.27 kworker/u2:0
Ensuite, aller voir http://votreserveur.votre-univ.fr:8080/geonetwork/
useradmin, mot de passeadmin
image du résultat attendu
remplacer la BDD H2 par une bdd postgres ou postgis
Quoi qu'on fasse geonetwork crée initialement une base de données h2. Comme l'environnement est encore vide, on va la remplacer par une base de données postgis ou postgres. Il me semble que selon une doc de geonetwork, ça n'est intéressant que si on a plusieurs dizaine de milliers de fiche. C'est pas notre cas (enfin à moi, hein), mais tout mettre dans une base de stype SQL, ça me rassure, car je sais les cloner, sauvegarder, restaurer, dupliquer, et éventuellement modifier en ligne de commande, alors que je ne sais rine faire de tout ça avec un base h2. De toutes façon, toujours de mémoire, geonetwork va se construire des index bien à lui à partir de la BDD SQL. donc pas de soucis.
Lorsqu'on utilise une base postgres simple, geonetwork utilise toujours un fichier pour son index spatial, avec une base postgis, même l'index spatial est géré par le moteur de base de données.
Si vous n'avez pas de serveur postgres sous la main, vous pouvez en installer un très rapidement, en suivant les instructions à la fin de cette page.
Astuce : faites des copier coller de chaque grand bloc. ils sont fait exprès pour ça.
- Arrêter tomcat8
systemctl stop tomcat8
- Fixer dans le shell courant qq variables qui correspondent à votre serveur de base de données. ça peut même être un serveur local sur la même machine. Ces variables vont faciliter la création des fichiers de configuration
TOMCAT_GEONETWORK_BASE_DIR=/var/lib/tomcat8/webapps/geonetwork DB_USER=ugeodb DB_PASSWORD=doqu2she8LooQu DB_NAME=geonetwork DB_SERVEUR=postgres-serveur.mon-univ.fr DB_PORT=5432
- définir une ou deux fonctions dans le shell courant, toujours pour faciliter les choses
cf() { cat >"$TOMCAT_GEONETWORK_BASE_DIR/$1" chown tomcat8: "$TOMCAT_GEONETWORK_BASE_DIR/$1" } message() { echo "$@" }
- Utiliser au choix, le postgres ou postgis
- Pour le pilote postgres
message utilisation du driver postgres # utilisation de postgres cf WEB-INF/config-node/srv.xml <<'EOH' <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <beans default-lazy-init="true" xmlns="http://www.springframework.org/schema/beans" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.springframework.org/schema/beans http://www.springframework.org/schema/beans/spring-beans.xsd" > <import resource="classpath*:/config-spring-geonetwork.xml"/> <import resource="../config-db/database_migration.xml"/> <bean id="nodeInfo" class="org.fao.geonet.NodeInfo"> <property name="id" value="srv" /> <property name="defaultNode" value="true" /> </bean> <!-- Uncomment the database configuration you need to use --> <!--<import resource="../config-db/h2.xml"/>--> <!--<import resource="../config-db/jndi-postgres-postgis.xml"/> --> <!--<import resource="../config-db/oracle.xml"/>--> <!--<import resource="../config-db/mysql.xml"/> --> <!--<import resource="../config-db/db2.xml"/> --> <import resource="../config-db/postgres.xml"/> <!--<import resource="../config-db/sqlserver.xml"/> --> <!--<import resource="../config-db/postgis.xml"/> --> </beans> EOH
- ou utilisation du pilote postgis
message utilisation du driver postgis # utilisation de postgis cf WEB-INF/config-node/srv.xml <<'EOH' <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <beans default-lazy-init="true" xmlns="http://www.springframework.org/schema/beans" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.springframework.org/schema/beans http://www.springframework.org/schema/beans/spring-beans.xsd" > <import resource="classpath*:/config-spring-geonetwork.xml"/> <import resource="../config-db/database_migration.xml"/> <bean id="nodeInfo" class="org.fao.geonet.NodeInfo"> <property name="id" value="srv" /> <property name="defaultNode" value="true" /> </bean> <!-- Uncomment the database configuration you need to use --> <!--<import resource="../config-db/h2.xml"/>--> <!--<import resource="../config-db/jndi-postgres-postgis.xml"/> --> <!--<import resource="../config-db/oracle.xml"/>--> <!--<import resource="../config-db/mysql.xml"/> --> <!--<import resource="../config-db/db2.xml"/> --> <!--<import resource="../config-db/postgres.xml"/>--> <!--<import resource="../config-db/sqlserver.xml"/> --> <import resource="../config-db/postgis.xml"/> </beans> EOH
- Configuration de l'accès à la base, postgres ou postgis. Même configuration
message "configuration de l'accès à la base de données postgis" cf WEB-INF/config-db/jdbc.properties <<EOH jdbc.username=$DB_USER jdbc.password=$DB_PASSWORD jdbc.database=$DB_NAME jdbc.host=$DB_SERVEUR jdbc.port=$DB_PORT jdbc.basic.removeAbandoned=true jdbc.basic.removeAbandonedTimeout=120 jdbc.basic.logAbandoned=true jdbc.basic.maxActive=33 jdbc.basic.maxIdle=\${jdbc.basic.maxActive} jdbc.basic.initialSize=\${jdbc.basic.maxActive} jdbc.basic.maxWait=200 jdbc.basic.testOnBorrow=true jdbc.basic.timeBetweenEvictionRunsMillis=10000 jdbc.basic.minEvictableIdleTimeMillis=1800000 jdbc.basic.testWhileIdle=true jdbc.basic.numTestsPerEvictionRun=3 jdbc.basic.poolPreparedStatements=true jdbc.basic.maxOpenPreparedStatements=1200 jdbc.basic.validationQuery=SELECT 1 jdbc.basic.defaultReadOnly=false jdbc.basic.defaultAutoCommit=false EOH
- redémarrage du serveur tomcat8
systemctl start tomcat8
Installer un serveur postgres si besoin
Vous n'avez pas de serveur postgres, pas grave. Installez en un sur votre serveur super rapidement :
- Installation du serveur
apt install postgresql apt-get -o apt::install-recommends=true install postgis
- devenir postgres pour les deux opérations suivantes :
su - postgres - Créer un utilisateur
ugeonetdbpour postgrescreateuser --no-createdb --encrypted --login --pwprompt --no-createrole --no-superuser ugeonetdb
- Créer une base de données pour cet utilisateur
createdb --owner=ugeonetdb --encoding=UTF-8 dbgeonetwork
- Si vous voulez installer postgis dans cette base pour que geonetwork utilise cette base de données pour sont index spatial, alors
psql dbgeonetwork <<<'CREATE EXTENSION postgis;' psql dbgeonetwork <<<'CREATE EXTENSION postgis_topology;'
- abandonner le compte postgres, retour en root
exit - Les paramètres de connexion seront alors
insérer le mot de passe que vous venez de définir:DB_USER=ugeonetdb DB_NAME=dbgeonetwork DB_SERVEUR=localhost DB_PORT=5432 DB_PASSWORD="Mettez ici le mot de passe de la BBD que vous venez de definir."
- Vous pouvez alors retourner à remplacer la BDD H2 par une bdd postgres ou postgis et poursuivre.
Auteur
— Christophe Martin 2017/05/18 17:04:29